La serie adapta los principales arcos del manga de Tite Kubo y añade historias exclusivas del anime. En Karakura, el estudiante Ichigo Kurosaki hereda los poderes de Segador de Almas de Rukia Kuchiki para proteger a sus hermanas de un Hollow. Aunque al principio duda, asume su responsabilidad, descubriendo que compañeros como Uryū Ishida, Orihime Inoue y Yasutora Sado ("Chad") también poseen habilidades espirituales.
Cuando Rukia es condenada por transgredir las normas del mundo humano, Ichigo y sus amigos, guiados por los exiliados Kisuke Urahara y Yoruichi Shihōin, se infiltran en la Sociedad de Almas para salvarla. Pronto se revela que el ex capitán Sōsuke Aizen manipuló todo para obtener el Hōgyoku, un artefacto capaz de fusionar Hollows y Segadores. Tras fingir su muerte, Aizen escapa a Hueco Mundo, secuestra a Orihime y planea crear el Ōken para derrocar al Rey Espiritual.
Después de entrenar con los Vizards, Ichigo lidera una incursión en Hueco Mundo, enfrentándose a los Espada, los Arrancar de élite al servicio de Aizen. Con la ayuda de su padre Isshin, también un Segador de Almas exiliado, Ichigo sacrifica su poder para derrotar a Aizen, sellándolo definitivamente.
Tiempo después, Ichigo se ve envuelto con los Fullbringers de Xcution, humanos con habilidades especiales liderados por el traicionero Kugo Ginjo. Tras recuperar sus poderes como Segador de Almas gracias al apoyo de la Sociedad de Almas, Ichigo derrota a Ginjo y reafirma su posición como protector de Karakura.
El anime introduce varios arcos originales: la guerra contra los Bount, humanos inmortales que absorben almas; la venganza de Shūsuke Amagai, un capitán que se rebela contra la Sociedad de Almas; la rebelión de los Zanpakutō liderada por Muramasa; y la amenaza de los Reigai, clones modificados de los Segadores creados por Kagerōza Inaba.
En la secuela Thousand-Year Blood War, Ichigo y sus aliados enfrentan una nueva amenaza: los Wandenreich, un imperio oculto de Quincy liderado por Yhwach. Aprovechando el vacío dejado tras la caída de Aizen, Yhwach inicia una guerra devastadora contra la Sociedad de Almas, provocando la desaparición de residentes y la aparición de una oscura amenaza que pondrá a prueba a Ichigo como nunca antes.